Metal Gear Solid 3: Subsistence - это переиздание оригинальной третьей части MGS.Действие разворачивается в период холодной войны — в 1964 году прошлого столетия. В скандал вокруг размещения Советским Союзом атомных боеголовок на Кубе помимо США втянуты еще несколько держав. Задача главного героя, получившего имя Снэйк (Naked Snake), — восстановить баланс сил и предотвратить эскалацию конфликта, вот-вот грозящего перерасти в третью мировую войну. Советский ученый Соколов, занят разработкой принципиально нового вида ядерного оружия. Но, поняв всю опасность адской машины им созданной и испугавшись последствий, он просит политического убежища на Западе. Только что организованное спецподразделение Фокс, задачей которого является выполнение особо опасных заданий на вражеской территории оперативниками-одиночками без какого либо снаряжения, отправляют на территорию Целиноярска, где содержится Соколов, того самого великого агента.