В Tenchu Z игрокам предстоит вжиться в образ ниндзя - бесшумного убийцы, мастерски владеющего как собственным телом, так и обширным арсеналом оружия, способным без звука убрать с дороги любого врага и выполнить любую задачу. На протяжении всех пятидесяти игровых миссий геймерам предстоит прятаться в тени, нападать из засад и искать иные способы выполнить поставленные задачи, не привлекая к себе лишнего внимания.